هدف اصلی عملیات مغزه گیری این است که اطلاعات دقیقی را در مورد مخزن نفت بدست آوریم. پارامترهایی مانند ترکیب نفت و آب، میزان اشباع شدگی یک مخزن را تعیین می کنند. اطلاعات مربوط به مخزن با تجزیه و تحلیل مغزه ها و نمونه های جمع آوری شده مورد ارزیابی قرار می گیرند.
در صورتی که گل حفاری به مغزه نفوذ پیدا کند، مایع بازیافت شده نمایانگر سیال موجود در آن محل نیست، بلکه ترکیبی از سیال موجود در گل حفاری و سیال مخزن می باشد. میزان آلودگی سیال مغزه موجود در آب سازند یک نمونه مغزه را می توان با استفاده از ردیاب تعیین نمود.
دوتریوم اکساید یا آب سنگین می تواند برای ردیابی سیستم های گل پایه آبی استفاده شود. قبل از مغزه گیری، مقداری دوتریوم اکساید به سیال حفاری آبی اضافه می شود و به صورت دوره ای، نمونه هایی از سیال مغزه، قبل، در طی و پس از فرآیند مغزه گیری، گرفته می شوند. سطح دوتریوم در نمونه های مایع استخراج شده و نمونه های سیال مغزه می تواند میزان آلودگی را تعیین کند.